L’università di Pisa fu fondata da papa Clemente VI.
Inizialmente le facoltà erano medicina, diritto canonico e civile.
Un notevole cambiamento avvenne con la richiesta del papa di permettere agli ecclesiastici di studiare all’università con i laici.
In questo periodo però ci fu un decadimento, dovuto alle guerre contro Firenze e la pestilenza.
Subito dopo ci fu una rinascita grazie all’intervento di Lorenzo de’ Medici che risollevò l’università, rinforzando il corpo insegnante, stabilendo alcuni obblighi come la divisa e la residenza.
In questo modo ci fu un aumento delle iscrizioni.
I più importanti studenti furono: il matematico Alfonso Borelli, lo studioso di anatomia Lorenzo Bellini e Galileo Galilei.